Variations in ribosomal DNA sequences and phylogeny of Globodera parasitising solanaceous plants

in Nematology
Restricted Access
Get Access to Full Text
Rent on DeepDyve

Have an Access Token?



Enter your access token to activate and access content online.

Please login and go to your personal user account to enter your access token.



Help

Have Institutional Access?



Access content through your institution. Any other coaching guidance?



Connect

Abstract

The D3 expansion region of the 28S gene and the ITS1-5.8S-ITS2 region of rDNA sequences from Globodera rostochiensis, G. pallida, G. tabacum tabacum, G. tabacum virginiae and G. tabacum solanacearum have been aligned and compared. There are no nucleotide differences in the D3 region sequences between G. rostochiensis and G. pallida. Sequence analysis and RFLPs of ITS-PCR products showed that several haplotypes are present in the genomes of G. rostochiensis and G. pallida populations. Restriction patterns of PCR products for eight enzymes for differentiation of these two species are given. Phylogenetic analysis of 41 ITS region sequences obtained from populations and species of the subfamily Punctoderinae revealed four distinct main clades within Globodera parasitising solanaceous plants: G. rostochiensis, G. tabacum, G. pallida and an undescribed Globodera sp. from South America. The utility of RFLP profiles and sequences of the rDNA are discussed for diagnostics and phylogeny of Globodera . Variabilité dans les séquences de l'ADN ribosomal et phylogénie des Globodera parasitant les Solanacées - La région d'expansion D3 du gène 28S et la région ITS1-5.8S-ITS2 des séquences d'ADNr de Globodera rostochiensis, G. pallida, G. tabacum tabacum, G. tabacum virginiae et G. tabacum solanacearum ont été alignées et comparées. Il n'y a pas de différence dans les nucléotides de la séquence de la région D3 entre G.rostochiensis et G.pallida. L'analyse séquentielle et les RFLP des produits du ITS-PCR montrent que plusieurs haplotypes sont présents dans les génomes des populations de G. rostochiensis et G. pallida. Les profils de restriction des produits du PCR de huit enzymes choisies pour la différenciation de ces deux espèces sont donnés. L'analyse phylogénique séquentielle de 41 regions ITS de populations et espèces appartenant à la sous-famille des Punctonerinae a révélé l'existence de quatre clades chez les Globodera parasitant les Solanacées: G. rostochiensis, G. tabacum, G. pallida et une espèce non décrite provenant d'Amérique du Sud. L'utilité pour le diagnostic et la phylogénie des Globodera des profils de RFLP et des séquences d'ADNr est discutée.

Variations in ribosomal DNA sequences and phylogeny of Globodera parasitising solanaceous plants

in Nematology

Sections

Index Card

Content Metrics

Content Metrics

All Time Past Year Past 30 Days
Abstract Views 9 9 5
Full Text Views 2 2 2
PDF Downloads 0 0 0
EPUB Downloads 0 0 0